Откройте окно 
Финансовый журнал.
Укажите в одной из строк журнала сумму по счету, а также счет ГК для импортного НДС.
В поле Общий тип учета укажите значение Покупка. В поле НДС бизнес-группа выберите учетную группу, указанную в комбинации с импортным НДС в окнеНастройка учета НДС. В поле НДС товарная группа выберите учетную группу, настроенную для импортного НДС (это необходимо сделать только если для счета ГК не задан ни один из этих кодов). Если поля НДС учетной группы не отображаются, их можно вставить при помощи функции выбора столбцов.
После заполнения полей выполните учет журнала.